Los bienes que integran la colección del MASM son mayoritariamente de procedencia eclesiástica, además de algunas donaciones particulares, como la de los Condes de Séguier.
Actualmente, la colección está formada por más de 1200 piezas de diferente tipología: pintura, escultura, orfebrería, numismática, arqueología, cerámica, documentación gráfica, téxtil y antropología.